Fate bollire il riso nero in abbondante acqua salata. Lavate i pomodori e asportatene la calotta superiore, che terrete da parte. Oppure, se preferite, divideteli a metà. Svuotateli da polpa e semi, (che terremo da parte per la ricetta degli spaghetti di zucchine), salateli e capovolgeteli perché perdano l’acqua di vegetazione. Nel frattempo fate saltare in padella le zucchine a dadini insieme alla cipolla. Scolate il riso, giunto a cottura e raffreddatelo sotto l’acqua corrente. Unite in una ciotola il riso, le zucchine spadellate ed il pesto di fave. Girate i pomodori e conditeli con un filo d'olio extravergine. Infine riempiteli con il riso e guarniteli con le loro calotte.